1 針對有機肥原料來源日益多樣化，部分原料中有毒有害物質超標等問題，農業部高度重視，會同有關部門加強管理、強化措施，保障有機肥質量安全。
2 一是規范有機肥管理。2013年實施的《畜禽規模養殖污染防治條例》規定，將畜禽糞便、污水、沼渣、沼液等用作肥料的，應當采取有效措施，消除可能引起傳染病的微生物。2017年5月印發的《國務院辦公廳關于加快推進畜禽養殖廢棄物資源化利用的意見》（國辦發〔2017〕48號）明確要求，強化商品有機肥原料和質量的監管和認證。
3 二是嚴格有機肥登記。按照《肥料登記管理辦法》要求，農業部和省級農業主管部門切實抓好生物有機肥和商品有機肥產品登記。根據有機肥原料成分復雜的特點，制定有機肥生產原料分類登記、登記證標明原料名稱及比例等管理制度，切實把好有機肥產品準入關。
4 三是加強有機肥使用指導。結合實施測土配方施肥、耕地保護與質量提升、東北黑土地保護利用試點項目，組織土壤肥料技術推廣人員深入生產一線，采取發放明白紙、示范觀摩和田間培訓等方式，指導農民科學積造農家肥，合理施用商品有機肥。
5 下一步，農業部將會同有關部門，組織專家開展有機肥原料安全性風險評估，篩選適宜生產有機肥的原料，研究提出有機肥原料中有毒有害物質限量指標，推動制定有機肥原料管理目錄制定，為生物質企業輔料等有機廢棄物資源化利用提供保障，推動資源循環利用，助力農業綠色發展。